Органами управления Союза являются:
- Общее собрание членов Союза;
- Председатель Совета Союза - Кожанов Никита Андреевич;
- Совет Союза;
- Устинов Владимир Игоревич – директор ООО "ФХ УСТИНОВА В.И." (Косихинский м.р-он)
- Махнаков Олег Николаевич – председатель СССПК "Колос" (Тальменский м.р-он)
- Андреев Денис Анатольевич – директор ООО «ПРОСТОР» (Алейский р-он)
- Капелькин Александр Сергеевич – директор ООО «Чумышское» (Кытмановский р-он)
- Поваров Евгений Юрьевич – глава КФХ Поваров Е.Ю. (Троицкий р-он)
- Лысов Сергей Павлович – директор ООО "КХ Лысова П.М." (Топчихинский р-он)
- Болотин Алексей Александрович – директор ООО «Союзагро» (г. Барнаул)
- Рифер Денис Александрович – директор ООО «Лео» (Калманский р-он)
- Васичев Сергей Сергеевич - член КФХ Васичев С.И. (Романовский р-он)
- Бойко Николай Евгеньевич - директор Алтайского филиала АО «Россельхозбанк» (г. Барнаул)
- Исполнительный директор Союза - Вайс Александр Александрович